Script en JavaScript que nos permite marcar/seleccionar todos los checkbox que existan en la pagina actual, lo que se hace es llamar a la función marcar en el evento ONCLICK del checkbox que marca/desmarca a todos, esa función recorrerá todos los elementos input de la página y cuando encuentre un checkbox le dará el valor de quien lo llamó (checkbox marcar/desmarcar todos)
<html>
<head>
<script type="text/javascript">
function marcar(source)
{
checkboxes=document.getElementsByTagName('input'); //obtenemos todos los controles del tipo Input
for(i=0;i<checkboxes.length;i++) //recoremos todos los controles
{
if(checkboxes[i].type == "checkbox") //solo si es un checkbox entramos
{
checkboxes[i].checked=source.checked; //si es un checkbox le damos el valor del checkbox que lo llamó (Marcar/Desmarcar Todos)
}
}
}
</script>
<title>Marcar todos los Checkbox</title>
</head>
<body>
<input type="checkbox" onclick="marcar(this);" /> Marcar/Desmarcar Todos
<hr/>
<input type="checkbox" name="check1" value="valor1">Valor 1<br/>
<input type="checkbox" name="check2" value="valor2">Valor 2<br/>
<input type="checkbox" name="check3" value="valor3">Valor 3<br/>
<input type="checkbox" name="check4" value="valor4">Valor 4<br/>
</body>
</html>
Aquí el Ejemplo: http://www.elcodigofuente.com/ejemplos/marcar_checkbox.html